本发明属于生物传感器技术领域,具体涉及一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器及其制备方法。
背景技术:
表面增强拉曼散射(sers)是一种强大的分析技术,因其超高的灵敏度,窄的光谱带以及在各种环境中的通用性性,广泛用于检测包括小分子,蛋白质和核酸在内的生物标记物。sers信号通常可以可通过金,银和铜纳米粒子(如银纳米球,金纳米球和金纳米棒)增强。与球形贵金属纳米粒子相比,银纳米立方体(agncs)由于具有其几何特征而提供了更大的电场增强。因此,agnc非常适合利用这些优势的sers应用增强的近场。例如,zhu等。通过在还原的氧化石墨烯板上包裹agncs开发出一种sers传感器,用于高度灵敏地检测二硫代氨基甲酸酯杀虫剂,检测限(lod)估计为10ppb。但据我们所知,agncs迄今尚未用作microrna(mirna)检测的sers底物。
酶辅助信号放大技术由于反应条件温和、生物相容性好和催化效率高等优点而广泛用于生化分析中。常用工具酶包括聚合酶、核酸内切酶、核酸外切酶、连接酶等。双链特异性核酸酶(dsn)为一种核酸内切酶,因其对dna双链体和rna/dna异源双链体有极强的切割偏好,对单链dna,单链rna和双链rna的活性较小的特性,而在mirna的信号放大中突显出巨大的优势。因此人们开发了许多基于dsn信号放大的传感器用于mirna的检测。如degliangeli等将荧光标记的dna探针固定在金纳米颗粒(aunps)上。当存在目标mirna时,dna-rna异源双链形成并被dsn识别并剪切,使得荧光基团从aunps上释放出来从而检测到荧光信号。目标mirna重复循环杂交酶切,从而释放出更多的荧光基团,实现信号放大。通过荧光信号的改变来实现对目标mirna的检测。
1990年代,gründler等人开发了具有对称结构的直接电加热电极,该电极能够消除加热交流电对电化学信号的干扰,从而导致了加热电极的广泛应用和推广。现已有一系列基于不同材料的加热电极已开发并应用于痕量检测,如用将石墨加热电极用于核黄素的高灵敏检测,将玻碳加热电极用于细胞的高敏感检测。此外,将加热电极与生物酶结合可提高酶活性,从而提高检测灵敏度。例如,wu等人将加热电极与核酸外切酶iii结合使用,可对实现对hg2 的高灵敏的电化学检测。但是据我们所知,加热电极还没有与双链特异性核酸酶(dsn)相结合,进行dsn辅助的目标循环扩增,并用sers方法进行mirna的检测。
技术实现要素:
本发明的目的在于提供一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器及其制备方法。
为实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器的制备方法,包括如下步骤:
(1)sers标签agncs/4-mba/sdna的组装
取10μm10μl巯基修饰的sdna,加入5mm10μltcep,室温避光放置1h,对二硫键进行还原,然后将其混入80μl8nm的agncs溶液中,加入300μl的pbss溶液混合均匀,37℃孵育过夜得到agncs/sdna;接着向溶液中加入1mm4μl的对巯基苯甲酸溶液,继续孵育2h;然后将溶液离心,去除上清液后重新分散在400μl的pbss溶液中,重复离心3次后4℃保存备用;
(2)dsn辅助目标循环信号放大过程;
将金热电极haue依次用1μm和0.05μm的氧化铝粉在抛光布上进行抛光,然后在超纯水中超声清洗3min,置于0.5mnaoh溶液中−0.35-1.35v电位间连续扫描500圈,接着置于5mmh2so4溶液中−0.35-1.5v电位间扫描20圈,对电极进行电化学清洗,最后用超纯水清洗冲洗,氮气吹干;
在固定pdna前,将10μm5μl巯基修饰的pdna与5mm5μltcep混匀室温避光处理1h以断裂二硫键,然后取10μl滴到清洗干净的金热电极表面,4℃组装过夜得到pdna/haue;超纯水冲洗后浸泡在2mmmch溶液中,室温封闭1h得到mch/pdna/haue,同样用超纯水对电极表面进行清洗;
取179μl一定浓度的mirna-21,加入20μl的10×dsnbuffer和0.5u/μl1μldsn酶配置成总体积为200μl的酶切液;将mch/pdna/haue浸泡于酶切液中进行酶切反应60min;酶切温度控制为55℃;反应完成后,向酶切液中加入10mm50μledta于55℃恒温反应10min,对dsn酶进行失活处理,得到所需的含有rdna的酶切液;
(3)sers基底的组装及检测
按照上述金热电极haue相同的处理方法,对直径为3mm的金电极aue进行抛光清洗;取10μm5μl巯基修饰的cdna与5mm5μltcep混匀,室温避光孵育1h;再加入pbs缓冲液稀释溶液至50μl;取10μl稀释液滴在清洗干净的aue表面,4℃组装过夜得到cdna/aue;用pbs缓冲液冲洗电极表面后置于200μl2mm的mch溶液中1h,随后置于200μl1wt.%的bsa溶液中1h,得到bsa/mch/cdna/aue;将电极用pbs缓冲液冲洗干净并用n2轻轻吹干电极表面;滴加10μl步骤(2)制备获得的含rdna的酶切液在电极表面,37℃杂交反应4h得到rdna/bsa/mch/cdna/aue;同样用pbs缓冲液冲洗电极表面除去电极表面未杂交的dna,然后电极浸泡于65μl制备好的sers标签agncs/4-mba/sdna中,37℃杂交反应4h得到sers基底;然后对基底表面检测进行得到sers信号。
所述sdna为ttttttagggt(t)8-(ch2)6sh;pdna为sh-(ch2)6-gcgcccaacatcagtctgataagctaccctaaaaaaccacacggcgc;cdna为sh-(ch2)6-(t)8gcgccgtgtgg。
本发明传感器原理:
将基于热电极的dsn辅助信号放大技术与和agncs的sers增强技术相结合,构建了用于mirna-21检测的sers传感器。如图1所示,该传感器的构建主要分为三个部分:sers标签的组装、基于热电极的dsn辅助目标循环信号放大、sers基底的组装(具体步骤详见下方传感器的制备过程)。对于sers标签的组装:信号探针sdna与拉曼信号分子4-mba均通过ag-s键组装到agncs表面得到sers标签agncs/4-mba/sdna。对于dsn辅助目标循环信号放大过程:巯基修饰的pdna,通过au-s键组装到haue表面,当目标mirna-21存在时,pdna的其中一部分将与目标杂交形成异源双链结构,双链体中的dna链会被dsn识别并剪切。mirna-21和pdna中剩余未杂交的部分(rdna)将被释放出来。释放出的mirna-21可以继续与pdna杂交进行下一个酶切循环,从而产生更多的rdna片段。在此过程中,通过提高haue的温度来提高dsn酶的活性,从而使得该过程进行更快更彻底。sers基底的组装过程:rdna的3´端可以与aue表面的捕获探针cdna杂交,5′端与sers标签上的sdna杂交,将sers标签组装到aue表面制得sers基底,从而在基底表面检测到sers信号。
本发明的优点在于:
本发明将agncs与4-mba和sdna相结合以制备sers标签。并将热电极技术与dsn辅助目标循环信号放大技术相结合,在dsn辅助目标循环信号放大过程中,通过提高电极的温度来提高dsn的活性,从而使得酶切循环过程更为高效彻底。本文的sers传感器对mirna-21的检出限达到2.9fm(s/n=3),且具有很高的特异性。
附图说明
图1为检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器原理图。
图2为不同温度下sers谱图,其中a为在不同电极温度下进行dsn辅助循环放大过程所得sers谱图,a-g:35℃、40℃、45℃、50℃、55℃、60℃、65℃,b为相应sers谱图在1586cm−1处的峰强变化。
图3为所述dsn用量、反应时间优化以及4-mba浓度的优化图,其中a为dsn用量优化图,b为反应时间优化,c为4-mba浓度的优化图。
图4为传感器对mirna-21的高灵敏检测图。
图5为传感器的选择性图。
具体实施方式
传感器的制备过程所用碱基序列以及缓冲液
tris缓冲液:10mmtris,0.1mnacl,ph7.4;
pbs缓冲液:10mmpb,0.1mnacl,ph7.4;
pbss缓冲液:10mmpb,0.1mnacl,0.01%(wt/vol)sds,ph7.4。
实施例1
一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器的制备方法,包括如下:
(1)sers标签agncs/4-mba/sdna的组装
取10μm10μl巯基修饰的sdna,加入5mm10μltcep,室温避光放置1h,对二硫键进行还原,然后将其混入80μl8nm的agncs溶液中,加入300μl的pbss溶液混合均匀,37℃孵育过夜得到agncs/sdna;接着向溶液中加入1mm4μl的对巯基苯甲酸溶液,继续孵育2h;然后将溶液离心,去除上清液后重新分散在400μlpbss溶液中,重复离心3次后4℃保存备用。
(2)dsn辅助目标循环信号放大过程;
将金热电极依次用1μm和0.05μm的氧化铝粉在抛光布上进行抛光,然后在超纯水中超声清洗3min,置于0.5mnaoh溶液中−0.35-1.35v电位间连续扫描500圈,接着置于5mmh2so4溶液中−0.35-1.5v电位间扫描20圈,对电极进行电化学清洗,最后用超纯水清洗冲洗,氮气吹干;
在固定pdna前,将10μm5μl巯基修饰的pdna与5mm5μltcep混匀室温避光处理1h以断裂二硫键,然后取10μl滴到清洗干净的金热电极表面,4℃组装过夜得到pdna/haue;超纯水冲洗后浸泡在2mmmch溶液中,室温封闭1h得到mch/pdna/haue,同样用超纯水对电极表面进行清洗;
取179μl一定浓度的mirna-21,加入20μl的10×dsnbuffer和0.5u/μl1μldsn酶配置成总体积为200μl的酶切液;将mch/pdna/haue浸泡于酶切液中进行酶切反应60min;酶切温度控制为55℃;反应完成后,向酶切液中加入10mm50μledta于55℃恒温10min,对dsn酶进行失活处理,得到所需的含有rdna的酶切液;
(3)sers基底的组装及检测
按照上述haue相同的处理方法,对直径为3mm的金电极(aue)进行抛光清洗;取10μm5μl巯基修饰的cdna与5mm5μltcep混匀,室温避光孵育1h;向上述混合液中加入pbs缓冲液稀释溶液至50μl;取10μl稀释液滴在清洗干净的aue表面,4℃组装过夜得到cdna/aue;用pbs缓冲液冲洗电极表面后置于置于200μl2mm的mch溶液中1h,随后置于200μl1wt.%的bsa溶液中1h,得到bsa/mch/cdna/aue;将电极用pbs缓冲液冲洗干净并用n2轻轻吹干电极表面;滴加10μl步骤(2)制备获得的含rdna的酶切液在电极表面,37℃杂交反应4h得到rdna/bsa/mch/cdna/aue;同样用pbs缓冲液冲洗电极表面除去电极表面未杂交的dna,然后电极浸泡于65μl制备好的sers标签agncs/4-mba/sdna中,37℃杂交反应4h得到sers基底;然后对基底表面检测进行得到sers信号。所用激光为he-ne,激光波长为632.8nm,激光功率为最大功率的5%。
实施例2温度的影响
双链特异性核酸酶(dsn)的活性与温度密切相关,为了研究金热电极haue的温度对dsn辅助目标循环信号放大过程的影响,将mch/pdna/haue浸入在含10pmmirna-21和0.6udsn的1×dsn缓冲溶液中,在不同电极温度下酶切90min。用不同温度下酶切所得溶液进行sers基底的组装,测得sers谱图。如图2所示,当haue温度从35℃升高到55℃时,sers峰强逐渐增加,而当温度高于60℃时,峰强开始下降。表明在一定范围内,升高温度可以提高dsn的活性,酶辅助循环过程更彻底,相应的sers信号更强。因此本发明选择55℃作为最佳温度。
实施例3dsn用量、反应时间优化以及4-mba浓度的优化
为了获得更优异的检测性能,对实验过程中一些重要的条件进行了优化:dsn辅助目标循环信号放大过程中dsn的用量和反应时间,以及sers标签的组装过程中信号分子4-mba的浓度进行了优化。选择1586cm−1处的sers峰强作为效果评估的指标。首先对dsn的用量进行了探究。如图3-a所示,当dsn用量从0.1u增加到0.5u时,sers强度也随之增强,当用量超过0.5u后强度基本保持不变。因此,将0.5u作为dsn的最佳用量。
然后对反应时间进行了优化,如图3-b所示,sers强度随着反应时间的延长而增加,于60min后趋于平稳。因此,将60min作为后续实验的最佳反应时间。
另外,4-mba的浓度直接影响到检测时的sers峰强,因此对4-mba的浓度也进行了优化。如图3-c,随着4-mba浓度从1μm增加到10μm,sers强度迅速增强。由于当4-mba的浓度超过10μm时,agncs粒子会出现聚集情况而无法继续试验,因此选择10μm作为4-mba分子的最佳浓度。
实施例4传感器对mirna-21的高灵敏检测
在最优实验条件下,使用不同浓度的mirna-21对传感器的分析性能进行探究。相应的sers谱图如图4-a,可以看出当mirna-21浓度从1×10−14m增加至1×10−9m,sers强度也逐渐增强。图4-c(曲线a)为sers强度与mirna-21浓度的对数的线性关系,可以看出sers强度与mirna-21浓度在10fm至1nm范围呈良好的线性关系。线性方程为y=33631.06 2283.48lgc(m)(r2=0.998),其中y表示1586cm−1处的sers峰强,计算得到检测限(lod)为2.9fm(s/n=3)。
为了进一步探索haue的温度对传感器检测的影响,探究了haue温度为25℃,在其它条件为最优条件下,sers峰强与mirna-21浓度间的关系。如图4-c(曲线b),mirna-21浓度与sers强度在100pm至10nm范围内呈线性关系,线性方程为y=8501.46 733.18lgc(m)(r2=0.96)。计算得到lod为7.4pm(s/n=3)。表明haue温度在55℃下,比在25℃下,检测极限可以降低大约3个数量级,进一步说明了通过提高haue的温度可以极大提高dsn的活性,从而提高mirna-21检测的灵敏度。
实施例5本发明sers传感器对其它mirna的响应:
我们使用mirna-141(uaacacugucugguaaagaugg),mirna-155(uuaaugcuaaucgugauaggggu)和非互补序列作为干扰物来评估该传感器的选择性。实验在相同的最佳条件下进行(即实施例1步骤),干扰物的浓度比目标物mirna-21(1pm)高10倍。如图5所示,在存在目标物mirna-21的情况下,可以观察到明显的sers信号,而空白实验(不存在mirna-21)或加入其他干扰物质时,几乎无sers信号。这些结果清楚地表明,本申请所提出的sers传感器对于mirna-21的检测具有极好的选择性。
实施例6本发明sers传感器用于血清中加标回收率检测:
为了验证该传感器在mirna-21检测中的适用性和可靠性,采用标准添加方法在血清样品中检测了目标mirna-21,结果如表1。将不同浓度的mirna-21(0.1、1和10pm)加入稀释100倍的血清中,回收率在80.2%至90.0%的范围内,相对标准偏差(rsd)在2.8%至6.9%之间。这些结果表明,所制备的传感器选择性高,有望用于实际样品检测。
表1
以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利范围所做的均等变化与修饰,皆应属本发明的涵盖范围。
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<110>福州大学
<120>检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器及其制备方法
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1.一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器的制备方法,其特征在于:包括如下:
(1)sers标签agncs/4-mba/sdna的组装
取10μm10μl巯基修饰的sdna,加入5mm10μltcep,室温避光放置1h,对二硫键进行还原,然后将其混入80μl8nm的agncs溶液中,加入300μl的pbss溶液混合均匀,37℃孵育过夜得到agncs/sdna;接着向溶液中加入1mm4μl的对巯基苯甲酸溶液,继续孵育2h;然后将溶液离心,去除上清液后重新分散在400μl的pbss溶液中,重复离心3次后4℃保存备用;
(2)dsn辅助目标循环信号放大过程;
将金热电极haue依次用1μm和0.05μm的氧化铝粉在抛光布上进行抛光,然后在超纯水中超声清洗3min,置于0.5mnaoh溶液中−0.35-1.35v电位间连续扫描500圈,接着置于5mmh2so4溶液中−0.35-1.5v电位间扫描20圈,对电极进行电化学清洗,最后用超纯水清洗冲洗,氮气吹干;
在固定pdna前,将10μm5μl巯基修饰的pdna与5mm5μltcep混匀室温避光处理1h以断裂二硫键,然后取10μl滴到清洗干净的金热电极表面,4℃组装过夜得到pdna/haue;超纯水冲洗后浸泡在2mmmch溶液中,室温封闭1h得到mch/pdna/haue,同样用超纯水对电极表面进行清洗;
取179μl一定浓度的mirna-21,加入20μl的10×dsnbuffer和0.5u/μl1μldsn酶配置成总体积为200μl的酶切液;将mch/pdna/haue浸泡于酶切液中进行酶切反应60min;酶切温度控制为55℃;反应完成后,向酶切液中加入10mm50μledta于55℃恒温反应10min,对dsn酶进行失活处理,得到所需的含有rdna的酶切液;
(3)sers基底的组装及检测
按照上述金热电极haue相同的处理方法,对直径为3mm的金电极aue进行抛光清洗;取10μm5μl巯基修饰的cdna与5mm5μltcep混匀,室温避光孵育1h;再加入pbs缓冲液稀释溶液至50μl;取10μl稀释液滴在清洗干净的aue表面,4℃组装过夜得到cdna/aue;用pbs缓冲液冲洗电极表面后置于200μl2mm的mch溶液中1h,随后置于200μl1wt.%的bsa溶液中1h,得到bsa/mch/cdna/aue;将电极用pbs缓冲液冲洗干净并用n2轻轻吹干电极表面;滴加10μl步骤(2)制备获得的含rdna的酶切液在电极表面,37℃杂交反应4h得到rdna/bsa/mch/cdna/aue;同样用pbs缓冲液冲洗电极表面除去电极表面未杂交的dna,然后电极浸泡于65μl制备好的sers标签agncs/4-mba/sdna中,37℃杂交反应4h得到sers基底;然后对基底表面检测进行得到sers信号。
2.根据权利要求1所述的一种检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器的制备方法,其特征在于:所述sdna为ttttttagggt(t)8-(ch2)6sh;pdna为sh-(ch2)6-gcgcccaacatcagtctgataagctaccctaaaaaaccacacggcgc;cdna为sh-(ch2)6-(t)8gcgccgtgtgg。
3.如权利要求1或2所述的制备方法制备获得的检测microrna的表面增强拉曼光谱传感器。
技术总结