冠状病毒关联数据的展示方法、装置、电子设备及介质与流程

专利2022-05-10  26



1.本公开涉及微生物技术领域,具体涉及冠状病毒关联数据的展示方法、装置、电子设备及介质。


背景技术:

2.冠状病毒自从被发现以来,人们对其病毒结构、致病、传染、分子生物学研究、基因组测序等等方面进行科学研究,产生了多种关联数据。
3.由于冠状病毒相关的关联数据数量较大,如何快速查找特定冠状病毒的相关数据并且进行展示,便成为了需要解决的问题。


技术实现要素:

4.本公开提出了冠状病毒关联数据的展示方法、装置及电子设备。
5.第一方面,本公开提供了一种冠状病毒关联数据的展示方法,包括:
6.获取目标病毒名称;
7.以所述目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,其中,所述图结构中的节点包括冠状病毒名称和冠状病毒关联数据,所述图结构中的边具有预设的权值,所述权值表示相应两个节点建立关联所需的步长;
8.将每个所述最短路径对应的终止节点进行展示。
9.在一些可选的实施方式中,所述以所述目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,包括:
10.基于迪杰斯特拉算法,在所述图结构中查找所述最短路径。
11.在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒关联数据包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据、冠状病毒抗体数据、冠状病毒文献数据和冠状病毒专利数据的至少一种。
12.在一些可选的实施方式中,所述图结构中边的权值通过以下方式确定:
13.确定所述边对应的两个节点是否为直接关联;
14.响应于确定是,将所述边的权值确定为1;
15.响应于确定否,确定所述边对应的两个节点之间中间媒介的个数n,并将所述边的权值确定为n 1。
16.在一些可选的实施方式中,所述获取目标病毒名称,包括:
17.获取用户输入的原始病毒名称;
18.根据预设的病毒名称标准化词库,确定所述原始病毒名称对应的标准病毒名称;
19.将所述标准病毒名称确定为所述目标病毒名称。
20.第二方面,本公开提供了一种冠状病毒关联数据的展示装置,包括:
21.获取模块,用于获取目标病毒名称;
22.查找模块,用于以所述目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中
查找相应的最短路径,其中,所述图结构中的节点包括冠状病毒名称和冠状病毒关联数据,所述图结构中的边具有预设的权值,所述权值表示相应两个节点建立关联所需的步长;
23.展示模块,用于将每个所述最短路径对应的终止节点进行展示。
24.在一些可选的实施方式中,所述查找模块进一步用于:
25.基于迪杰斯特拉算法,在所述图结构中查找所述最短路径。
26.在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒关联数据包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据、冠状病毒抗体数据、冠状病毒文献数据和冠状病毒专利数据的至少一种。
27.在一些可选的实施方式中,所述图结构中边的权值通过以下方式确定:
28.确定所述边对应的两个节点是否为直接关联;
29.响应于确定是,将所述边的权值确定为1;
30.响应于确定否,确定所述边对应的两个节点之间中间媒介的个数n,并将所述边的权值确定为n 1。
31.在一些可选的实施方式中,所述获取模块进一步用于:
32.获取用户输入的原始病毒名称;
33.根据预设的病毒名称标准化词库,确定所述原始病毒名称对应的标准病毒名称;
34.将所述标准病毒名称确定为所述目标病毒名称。
35.第三方面,本公开提供了一种电子设备,包括:
36.一个或多个处理器;
37.存储装置,用于存储一个或多个程序;
38.当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如本公开第一方面任一实施方式描述的方法。
39.第四方面,本公开还提供了一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,其中,所述程序被处理器执行时实现如本公开第一方面任一实施方式描述的方法。
40.本实施例中的冠状病毒关联数据的展示方法、装置及电子设备,以目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,并且将每个最短路径对应的终止节点进行展示,能够快速查找特定冠状病毒的相关数据并且进行展示,有利于对查询请求做出快速响应。
附图说明
41.通过阅读参照以下附图所作的对非限制性实施例所作的详细描述,本公开的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
42.图1是本公开的一个实施例可以应用于其中的示例性系统架构图;
43.图2a是根据本公开的冠状病毒关联数据的展示方法的一个实施例的流程图;
44.图2b是根据本公开的冠状病毒关联数据的展示方法的一个例子的示意图;
45.图3是根据本公开的冠状病毒关联数据的展示装置的一个实施例的结构示意图;
46.图4是适于用来实现本公开的电子设备的计算机系统的结构示意图。
具体实施方式
47.下面结合附图和实施例对本公开作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释相关发明,而非对该发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与有关发明相关的部分。
48.需要说明的是,在不冲突的情况下,本公开中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本公开。
49.图1示出了可以应用本公开的冠状病毒关联数据的展示方法或冠状病毒关联数据的展示装置的实施例的示例性系统架构100。
50.如图1所示,系统架构100可以包括终端设备101、网络102和服务器103。网络102用以在终端设备101和服务器103之间提供通信链路的介质。网络102可以包括各种连接类型,例如有线、无线通信链路或者光纤电缆等等。
51.用户可以使用终端设备101通过网络102与服务器103交互,以接收或发送消息等。终端设备101上可以安装有各种通讯客户端应用,例如冠状病毒信息数据记录类应用、冠状病毒信息数据处理类应用、网页浏览器应用等。
52.终端设备101可以是硬件,也可以是软件。当终端设备101为硬件时,可以是具有显示屏并且支持信息输入(比如,文本输入和/或语音输入等)的各种电子设备,包括但不限于智能手机、平板电脑、膝上型便携计算机和台式计算机等等。当终端设备101为软件时,可以安装在上述所列举的电子设备中。其可以实现成多个软件或软件模块(例如用来提供冠状病毒关联数据的展示服务),也可以实现成单个软件或软件模块。在此不做具体限定。
53.服务器103可以是提供各种服务的服务器,例如对终端设备101发送的冠状病毒信息查询请求提供处理服务的后台服务器。后台服务器可以对接收到的冠状病毒信息查询请求进行处理操作,并将操作结果(例如冠状病毒关联数据)反馈给终端设备。
54.在一些情况下,本公开所提供的冠状病毒关联数据的展示方法可以由终端设备101和服务器103共同执行,例如,“获取冠状病毒信息数据”和“以目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径”的步骤可以由服务器103执行,“将每个最短路径对应的终止节点进行展示”的步骤可以由终端设备101执行。本公开对此不做限定。相应地,冠状病毒关联数据的展示装置也可以分别设置于终端设备101和服务器103中。
55.在一些情况下,本公开所提供的冠状病毒关联数据的展示方法可以由服务器103执行,相应地,冠状病毒关联数据的展示装置也可以设置于服务器103中,这时,系统架构100也可以不包括终端设备101。
56.在一些情况下,本公开所提供的冠状病毒关联数据的展示方法可以由终端设备101执行,相应地,冠状病毒关联数据的展示装置也可以设置于终端设备101中,这时,系统架构100也可以不包括服务器103。
57.需要说明的是,服务器103可以是硬件,也可以是软件。当服务器103为硬件时,可以实现成多个服务器组成的分布式服务器集群,也可以实现成单个服务器。当服务器103为软件时,可以实现成多个软件或软件模块(例如用来提供冠状病毒关联数据的展示服务),也可以实现成单个软件或软件模块。在此不做具体限定。
58.应该理解,图1中的终端设备、网络和服务器的数目仅仅是示意性的。根据实现需要,可以具有任意数目的终端设备、网络和服务器。
59.继续参考图2a,其示出了根据本公开的冠状病毒关联数据的展示方法的一个实施例的流程200。该冠状病毒关联数据的展示方法包括以下步骤:
60.步骤201,获取目标病毒名称。
61.在一个例子中,该展示方法由终端设备实施,此时,终端设备可以接收用户输入的病毒名称并将其作为目标病毒名称。
62.在一个例子中,该展示方法由终端设备和服务器共同实施。此时,用户可以在终端设备输入病毒名称并将其发送至服务器,以便使服务器获得目标病毒名称。
63.用户输入的病毒名称(以下称为原始病毒名称)可能是病毒的物种科学名称,也可能是病毒的曾用名、常用写法、错误写法、基因名写法等。
64.终端设备或者服务器可以在获得原始病毒名称后,根据预设的病毒名称标准化词库,确定原始病毒名称对应的标准病毒名称,并且将标准病毒名称确定为目标病毒名称。这里,病毒名称标准化词库可以对应存储有标准词和相应的非标准词。其中,标准词可以是某个病毒的物种科学名称,对应的非标准词可以是该病毒的曾用名、常用写法、错误写法、基因名写法等。
65.通过上述步骤,可以将原始病毒名称处理为标准病毒名称,以便后续进行查找匹配。
66.步骤202,以目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,其中,图结构中的节点包括冠状病毒名称和冠状病毒关联数据,图结构中的边具有预设的权值,权值表示相应两个节点建立关联所需的步长。
67.在一个例子中,图结构中的冠状病毒名称可以是冠状病毒的物种科学名称,即标准病毒名称,例如“severe acute respiratory syndrome coronavirus 2”。
68.在一个例子中,冠状病毒关联数据可以包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据、冠状病毒抗体数据、冠状病毒文献数据和冠状病毒专利数据的至少一种。冠状病毒核酸数据,例如是冠状病毒的基因序列。冠状病毒蛋白数据,例如是冠状病毒的蛋白序列。冠状病毒晶体结构数据,例如是冠状病毒的蛋白三维晶体结构数据。冠状病毒抗体数据,例如是冠状病毒相关的抗体信息。冠状病毒文献数据,例如是记载了冠状病毒相关信息的科研文献数据。冠状病毒专利数据,例如是记载了冠状病毒相关信息的专利数据。
69.在一个例子中,图结构中边的权值通过以下方式确定:首先,确定边对应的两个节点是否为直接关联。其次,在两个节点直接关联的情况下,将边的权值确定为1。在两个节点不直接关联的情况下,确定边对应的两个节点之间中间媒介的个数n,并将边的权值确定为n 1。例如,节点a为某个核酸,节点b为该核酸具有的某个基因,则节点a和节点b直接关联,二者建立关联所需的步长为1。相应地,节点a和节点b之间的边ab的权值为1。又例如,节点a为某个核酸,节点c为某个文献,该文献中直接记载了该核酸的序列编号,则节点a和节点c直接关联,二者建立关联所需的步长为1。相应地,节点a和节点c之间的边ac的权值为1。又例如,节点a为某个核酸,节点d为某个文献,该核酸具有某个基因,该文献没有直接记载该核酸,但是记载了该核酸具有的基因,则节点a和节点d不直接关联,二者之间存在一个中间媒介(即该核酸包括的基因),二者建立关联所需的步长为2。相应地,节点a和节点d之间的边ad的权值为2。
70.在一个例子中,可以基于迪杰斯特拉(dijkstra)算法,在图结构中查找最短路径。迪杰斯特拉(dijkstra)算法是典型的用来解决最短路径的算法,由荷兰计算机科学家狄克斯特拉于1959年提出,用来求得从起始点到其他所有点最短路径。该算法采用了贪心的思想,每次都查找与该点距离最近的点。
71.在本实施例中,路径的长度为路径中各个边的权值之和。
72.在一个例子中,可以通过以下方式在图结构中查找最短路径:(1)以目标病毒名称对应的节点为起始节点,以各个冠状病毒关联数据(例如冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据、冠状病毒抗体数据、冠状病毒文献数据或者冠状病毒专利数据)等为终止节点,将相邻点之间权值表示为弧长(arcs)。若弧不存在,则置弧长为∞。s为已找到的从起始节点v出发的终止节点的集合。s初始状态为空集。那么,从起始节点v出发到图上其余各顶点v
i
可能达到的长度的初值为:d=arcs[locate vex(g,v
i
)],v
i
∈v;(2)选择v
j
,使得d[j]=min{d|v
i
∈v

s};(3)修改从v出发的到集合v

s中任一顶点v
j
最短路径长度。其中,v为起始节点,v
i
为终止节点,d为从起始节点到每个终止节点的路径长度,d[j]为从起始节点到每个终止节点的最小路径长度,g为图结构。
[0073]
在一个例子中,对于图2b所示的节点图,假设以病毒a为起始节点,按照上述方法可以得到病毒a到其余节点的最短路径。其中,病毒a到核酸a的最短路径为病毒a

核酸a,路径长度为2。病毒a到文献a的最短路径为病毒a

核酸a

文献a,路径长度为3。病毒a到基因a的最短路径为病毒a

核酸a

基因a,路径长度为4。病毒a到核酸b之间的路径长度为无穷大,即不存在最短路径。
[0074]
步骤203,将每个最短路径对应的终止节点进行展示。
[0075]
在图2b所示的例子中,以病毒a为起始节点的最短路径包括“病毒a

核酸a”、“病毒a

核酸a

文献a”和“病毒a

核酸a

基因a”。可以将每个最短路径的终止节点,即核酸a、文献a和基因a进行展示。从用户角度看,其在终端设备中输入了病毒a,之后终端设备反馈了病毒a关联的关联数据,即核酸a、文献a和基因a。
[0076]
在本实施例的冠状病毒关联数据的展示方法中,以目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,并且将每个最短路径对应的终止节点进行展示。由于终止节点和起始节点中存在路径,因此保证了终止节点和起始节点之间具备关联性。由于运用了最短路径查找方法,有利于降低查找时间,提高查找效率。因此,本实施例中的方法能够快速查找特定冠状病毒的相关数据并且进行展示,有利于对查询请求做出快速响应。
[0077]
进一步参考图3,作为对上述各图所示方法的实现,本公开提供了一种冠状病毒关联数据的展示装置的一个实施例,该装置实施例与图2a所示的方法实施例相对应,该装置具体可以应用于各种电子设备中。
[0078]
如图3所示,本实施例的冠状病毒关联数据的展示装置300可以包括:获取模块301、查找模块302和展示模块303。其中,获取模块301可以用于获取目标病毒名称;查找模块302可以用于以目标病毒名称对应的节点为起始节点,在预设的图结构中查找相应的最短路径,其中,图结构中的节点包括冠状病毒名称和冠状病毒关联数据,图结构中的边具有预设的权值,权值表示相应两个节点建立关联所需的步长;展示模块303可以用于将每个最短路径对应的终止节点进行展示。
[0079]
在本实施例中,冠状病毒关联数据的展示装置300的获取模块301、查找模块302和展示模块303的具体处理及其所带来的技术效果可分别参考图2a对应实施例中步骤201、步骤202和步骤203的相关说明,在此不再赘述。
[0080]
在一些可选的实施方式中,查找模块302可以进一步用于:基于迪杰斯特拉算法,在图结构中查找最短路径。
[0081]
在一些可选的实施方式中,冠状病毒关联数据包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据、冠状病毒抗体数据、冠状病毒文献数据和冠状病毒专利数据的至少一种。
[0082]
在一些可选的实施方式中,图结构中边的权值通过以下方式确定:确定边对应的两个节点是否为直接关联;响应于确定是,将边的权值确定为1;响应于确定否,确定边对应的两个节点之间中间媒介的个数n,并将边的权值确定为n 1。
[0083]
在一些可选的实施方式中,获取模块301可以进一步用于:获取用户输入的原始病毒名称;根据预设的病毒名称标准化词库,确定原始病毒名称对应的标准病毒名称;将标准病毒名称确定为目标病毒名称。
[0084]
需要说明的是,本公开提供的冠状病毒关联数据的展示装置中各模块的实现细节和技术效果可以参考本公开中其它实施例的说明,在此不再赘述。
[0085]
下面参考图4,其示出了适于用来实现本公开的电子设备的计算机系统400的结构示意图。图4示出的电子设备仅仅是一个示例,不应对本公开的功能和使用范围带来任何限制。
[0086]
如图4所示,计算机系统400包括中央处理单元(cpu,central processing unit)401,其可以根据存储在只读存储器(rom,read only memory)402中的程序或者从存储部分408加载到随机访问存储器(ram,random access memory)403中的程序而执行各种适当的动作和处理。在ram403中,还存储有系统400操作所需的各种程序和数据。cpu401、rom402以及ram403通过总线404彼此相连。输入/输出(i/o,input/output)接口405也连接至总线404。
[0087]
以下部件连接至i/o接口405:包括触控屏、手写板、键盘或鼠标等的输入部分406;包括诸如阴极射线管(crt,cathode ray tube)、液晶显示器(lcd,liquid crystal display)等以及扬声器等的输出部分407;包括硬盘等的存储部分408;以及包括诸如lan(局域网,local area network)卡、调制解调器等的网络接口卡的通信部分409。通信部分409经由诸如因特网的网络执行通信处理。
[0088]
特别地,根据本公开的实施例,上文参考流程图描述的过程可以被实现为计算机软件程序。例如,本公开的实施例包括一种计算机程序产品,其包括承载在计算机可读介质上的计算机程序,该计算机程序包含用于执行流程图所示的方法的程序代码。在这样的实施例中,该计算机程序可以通过通信部分409从网络上被下载和安装。在该计算机程序被中央处理单元(cpu)401执行时,执行本公开的方法中限定的上述功能。需要说明的是,本公开的计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质或者是上述两者的任意组合。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的系统、装置或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子可以包括但不限于:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机访问存
储器(ram)、只读存储器(rom)、可擦式可编程只读存储器(eprom或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(cd

rom)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本公开中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用。而在本公开中,计算机可读的信号介质可以包括在基带中或者作为载波一部分传播的数据信号,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的数据信号可以采用多种形式,包括但不限于电磁信号、光信号或上述的任意合适的组合。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用的程序。计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括但不限于:无线、电线、光缆、rf等等,或者上述的任意合适的组合。
[0089]
可以以一种或多种程序设计语言或其组合来编写用于执行本公开的操作的计算机程序代码,程序设计语言包括面向对象的程序设计语言—诸如java、smalltalk、c 、python,还包括常规的过程式程序设计语言—诸如“c”语言或类似的程序设计语言。程序代码可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络——包括局域网(lan)或广域网(wan)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。
[0090]
附图中的流程图和框图,图示了按照本公开各种实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上,流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段、或代码的一部分,该模块、程序段、或代码的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。也应当注意,在有些作为替换的实现中,方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如,两个接连地表示的方框实际上可以基本并行地执行,它们有时也可以按相反的顺序执行,这依所涉及的功能而定。也要注意的是,框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合,可以用执行规定的功能或操作的专用的基于硬件的系统来实现,或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
[0091]
描述于本公开中所涉及到的模块可以通过软件的方式实现,也可以通过硬件的方式来实现。所描述的模块也可以设置在处理器中,例如,可以描述为:一种处理器包括获取模块、查找模块和展示模块。其中,这些模块的名称在某种情况下并不构成对该模块本身的限定,例如,获取模块还可以被描述为“获取目标病毒名称的模块”。
[0092]
作为另一方面,本公开还提供了一种计算机可读介质,该计算机可读介质可以是上述实施例中描述的装置中所包含的,也可以是单独存在而未装配入该装置中。上述计算机可读介质承载有一个或者多个程序,当上述一个或者多个程序被该装置执行时,使得该装置:获取冠状病毒信息数据,其中,冠状病毒信息数据包括冠状病毒生物数据和相应的冠状病毒元数据;冠状病毒生物数据用于描述冠状病毒的生物信息,冠状病毒生物数据包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据和冠状病毒抗体数据中的至少一种;冠状病毒元数据用于描述相应的冠状病毒生物数据的属性;根据预设的标准化词库,对冠状病毒元数据进行标准化处理,得到相应的冠状病毒标准化元数据;根据冠状病
毒标准化元数据,确定不同的冠状病毒生物数据之间的关联关系,以形成冠状病毒信息整合数据集。
[0093]
以上描述仅为本公开的较佳实施例以及对所运用技术原理的说明。本领域技术人员应当理解,本公开中所涉及的发明范围,并不限于上述技术特征的特定组合而成的技术方案,同时也应涵盖在不脱离上述发明构思的情况下,由上述技术特征或其等同特征进行任意组合而形成的其它技术方案。例如上述特征与本公开中公开的(但不限于)具有类似功能的技术特征进行互相替换而形成的技术方案。
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