本发明涉及膨腹海马生长关联snp位点的单倍型在育种中的应用，属于水产育种。
背景技术：
1、全球气候变化、生态环境污染和过度捕捞导致海马野生种质资源质量降低。养殖海马主要依靠野生原种繁育后代，由于各种无序交配及缺乏对种质资源的严格把控，造成养殖海马在生长、抗病和适温能力等方面衰退严重，极大制约海马工厂化养殖的发展。培育具有生长优势的海马良种意义重大。
2、目前，尚无膨腹海马（distended hippocampus）生长关联snp位点的单倍型应用于育种的相关报道，与之相似的有线纹海马生长相关微卫星标记。然而，微卫星标记只能通过电泳片段大小进行粗略鉴别，无法精确定位生长相关snp，也无法判断具有生长优势的线纹海马是否纯合和可遗传。
技术实现思路
1、为解决现有技术的不足，本发明提供膨腹海马生长关联snp位点的单倍型在育种中的应用，克服多种因子的限制，严格调控膨腹海马生长过程，可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
2、为实现上述目标，本发明采用如下技术方案：
3、膨腹海马生长关联snp位点的单倍型在育种中的应用，所述单倍型包括：单倍i型、单倍ii型和单倍iii型，单倍i型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是c、t，单倍ii型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是c、c，单倍iii型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是t、c，其中，单倍i型和单倍ii型随机形成纯合双倍i型c1034c1034t1199t1199和杂合双倍ii型c1034c1034t1199c1199两种双倍型，单倍ii型和单倍iii型随机形成纯合双倍iii型c1034c1034c1199c1199、纯合双倍iv型t1034t1034c1199c1199和杂合双倍v型c1034t1034c1199c1199三种双倍型，单倍iii型随机形成的纯合双倍iv型相比于其它四种双倍型在平均体重、平均增重量、aldh18a1基因表达和谷氨酸激酶活性等方面具有显著优势，单倍iii型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
4、本发明的有益之处在于：将膨腹海马aldh18a1基因的2个snp位点（分别位于aldh18a1基因外显子1034和1199处）与膨腹海马生长性状进行关联分析，发现该2个snp位点与生长性状显著相关，其中，单倍iii型（t1034c1199）个体生长性能显著提高，通过进一步对三种双倍型（diii（c1034c1034c1199c1199）、div（t1034t1034c1199c1199）、dv（c1034t1034c1199c1199））个体进行生长对比分析，发现膨腹海马体重和aldh18a1基因表达在不同双倍型中存在显著差异，其中，div（t1034t1034c1199c1199）膨腹海马的aldh18a1基因相对表达量和谷氨酸激酶活性显著高于其它两种双倍型，单倍iii型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种，加快海马速生良种的选育进程。
1.膨腹海马生长关联snp位点的单倍型在育种中的应用，其特征在于，所述单倍型包括：单倍i型、单倍ii型和单倍iii型，单倍i型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是c、t，单倍ii型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是c、c，单倍iii型的aldh18a1基因外显子1034和1199处的碱基分别是t、c，其中，单倍i型和单倍ii型随机形成纯合双倍i型c1034c1034t1199t1199和杂合双倍ii型c1034c1034t1199c1199两种双倍型，单倍ii型和单倍iii型随机形成纯合双倍iii型c1034c1034c1199c1199、纯合双倍iv型t1034t1034c1199c1199和杂合双倍v型c1034t1034c1199c1199三种双倍型，单倍iii型随机形成的纯合双倍iv型相比于其它四种双倍型在平均体重、平均增重量、aldh18a1基因表达和谷氨酸激酶活性等方面具有显著优势，单倍iii型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
